Az első évad óriási sikere után a Telltale Games tovább folytatja a Minecraft kalandjátékot, amelynek főszereplője ismét Jesse lesz, aki különleges kis csapata oldalán egyszer már megmentette az egész világot Wither Storm legyőzésével.
A Minecraft Story Mode - Season 2-ben Jesse és barátai így ünnepelt hősök, igazi hírességek a maguk kis világában, azonban mielőtt a fejükbe száll a dicsőség, és teljesen eltávolodnak egymástól, egy újabb kaland körvonalazódik a kis csoport előtt, egy hátborzongató víz alatti templommal a középpontban.
Jesse így újra összetrombitálja a barátokat, és nekiindulnak, hogy megoldják a rejtélyt, miközben rádöbbennek arra, hogy céljuk ezúttal sem kisebb, minthogy újra megmentsék az egész világot, amit a korábban megszokott módon kivitelezhetnek majd.
A Minecraft Story Mode - Season 2 a Telltale kalandjaira jellemző sajátosságokat vonultatja fel, így az izgalmas történetet újfent döntési lehetőségek sokasága színesíti, miközben mi irányíthatjuk a történet alakulását, sőt mi több, közben még némi akcióra és pár fejtörőre is számítanunk kell.